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林烟草Sig2的生物信息学分析
在植物体内,sigma因子由一个较小的核基因家族编码,并在叶绿体中发挥转录起始的作用。本研究通过生物信息学的方法,对林烟草的 sig2 基因及其蛋白序列进行了一系列的结构和功能分析。结果分析表明,林烟草的Nssig2为不稳定蛋白,不含信号肽序列,不是分泌蛋白,也不是细胞膜蛋白,最可能定位在叶绿体;二级结构预测表明林烟草Nssig2蛋白中的二级构象... (2016年09月23日)
小麦
TaCIPK2
基因克隆及与TaCBLs蛋白互作分析
以普通六倍体小麦品种德抗961为材料,根据野大麦 HbCIPK2 的mRNA序列(GenBank序列号JN831652)设计引物,采用同源克隆方法从小麦中克隆 TaCIPK2 基因(GenBank序列号KU640381),测序结果显示该基因序列全长1 421 bp,开放阅读框(ORF) 1 359 bp,编码452个氨基酸残基,预测分子量为50.... (2016年07月29日)
植物油脂合成的分子调控机制
油脂是植物体内最高能量物质的贮藏形式,为人类提供热量及一些必需脂肪酸,也可以替代石油作为原料用于化工或生物燃料。油脂是植物种子重要的储藏物质,其积累水平与种子的发育密切相关。研究已发现多种转录因子在影响种子发育的同时,对油脂的合成和积累具有重要的调控作用,如 WRI1 ( WRINKLED1 )、 FUS3 ( FUSCA3 )、 ABI3 ... (2016年06月20日)
水稻灌浆期籽粒中光信号相关基因鉴定与表达分析
光是影响水稻生长发育重要的环境因素,光作为信号物质调控水稻众多生长发育过程,但光信号在水稻籽粒灌浆中的作用研究较少。本研究利用高通量测序技术,对水稻灌浆期强、弱势粒中光信号途径相关基因进行了鉴定,从抽穗后10 d、15 d、21 d、27 d和35 d 5个灌浆时期,鉴定出了5个光受体基因,9个光信号途径调控因子基因,8个光信号途径其他基因共22个光信... (2016年07月29日)
莲瓣兰花朵转录组及特性分析
莲瓣兰是我国珍贵的兰花野生资源,具有很高的观赏价值,然而其相关的分子生物学研究尚属空白。为揭示莲瓣兰花朵形成的分子机制,应用高通量测序技术对莲瓣兰花朵进行转录组分析。原始数据经过生物信息学分析后,共获得57011条Unigene;所获得的Unigene与Nr,Swiss-prot,COG和KEGG等数据库进行搜索比对后,发现Unigene的注释总... (2016年07月20日)
兴安落叶松咖啡酸-O-甲基转移酶基因的克隆及特性分析
本研究利用兼并-PCR及RACE技术克隆了兴安落叶松( Larix gmelinii )的咖啡酸-O-甲基转移酶基因(命名为 Lg COMT ),并对其基因结构和表达模式进行了分析。所克隆的 LgCOMT cDNA全长为1 173 bp,包含1 092 bp的开放阅读框,编码364个氨基酸;基因组DNA全长为1 400 bp,包含3个外显子和... (2016年09月23日)
旱柳与龙爪柳α微管蛋白基因家族的克隆与序列分析
本研究以杨树和拟南芥α微管蛋白氨基酸序列为探针,利用本地化BLAST工具搜索柳树全基因组数据库,根据搜索所获序列克隆旱柳和龙爪柳α微管蛋白基因。通过qRT-PCR技术分析不同柳树组织中α微管蛋白基因的表达水平,并利用BioEdit和MEGA5软件分别进行序列相似性和系统发育分析。结果显示,两种柳树各有8个&al... (2016年09月28日)
花香A香味基因的鉴定和表达分析
选择和培育综合性状优良、配合力好的香稻亲本,对提高杂交水稻香稻育种至关重要。花香A是四川省农业科学院生物技术核技术研究所通过航天育种技术培育而成的优良香稻不育系,其配制的组合米质优、香味浓。为了探究花香A香味产生的原因,本研究鉴定了花香A香味基因的类型,研究了遗传规律和表达模式等,发现其香味基因类型为Badh2-E7,香味基因 Bad... (2016年06月20日)
地方晒烟种质资源SRAP标记的遗传多样性分析
解析地方晒烟种质资源的遗传背景,为晒烟种质的高效利用提供依据。本研究筛选多态性丰富的14对SRAP引物组合,对贵州省内广泛地理来源的136份地方性晒烟资源进行遗传多样性分析,根据Model-base和NJ聚类进行遗传结构分析。结果表明:参试材料具有较高的遗传多样性,共扩增出250个稳定的多态性位点,多态性位点比率为97.6%,有效等位基因数( ... (2016年06月20日)
家蚕抗菌肽cecropin A的表达特征及体内外抑菌研究
家蚕抗菌肽cecropin A ( BmCecA )是家蚕体液免疫中产生的一种重要的抗菌肽。本研究利用RT-PCR技术克隆出 BmCecA 基因的开放阅读框(ORF),该ORF编码22个氨基酸的信号肽和37个氨基酸的成熟肽,通过蛋白结构分析该成熟肽形成经典的双亲α螺旋。实时荧光定量PCR表明, BmCecA 在5龄家蚕的体壁、马氏管、中肠、... (2016年06月25日)
杜仲转录组SSR发掘及标记开发
为了加强对杜仲资源的有效保护和可持续利用,了解杜仲的遗传背景,我们基于杜仲雌雄株转录组数据库开发SSR标记,能够应用于杜仲的功能基因发掘、分子标记辅助育种、遗传多样性分析、遗传图谱构建等研究。基于杜仲雌雄株转录组数据库Unigenes序列,利用MISA软件进行SSRs序列查找及其特征分析;根据微卫星的两翼序列设计引物,以1份随机挑选的... (2006年06月20日)
chyb基因的玉米遗传转化及后代性状分析
采用“成熟胚原位转化法”用带有质粒pCambia2300- Lcchyb-bar 的根癌农杆菌C58,侵染玉米芽尖生长点,将 chyb 基因转入玉米优良品系7 922中。T 0 代植株不进行筛选,T 1 代植株用浓度为250 mg/L草铵膦筛选,存活植株进行PCR和RT-PCR检测,T 1 代获得24株阳性植株。T 2 代... (2016年09月12日)
烤烟易烤性连锁标记的适用性验证
烤烟的易烤性影响了烘烤过程中的变黄过程,直接影响烤后烟叶的外观质量。本研究对5个与烤烟易烤性紧密连锁的分子标记进行了有效性检测。结果表明,在云烟85和大白筋599组合的F2群体中利用亲本带型进行分离群体分组,除标记PT53143外,其余4个标记其组间易烤性差异均达到显著以上水平;在自然群体中,以易烤品种云烟85的等位基因型为优异基因型,根据供试品种含有... (2016年02月20日)
萝卜叶绿体及线粒体基因组测序与组装
为从分子水平上探讨萝卜雄性不育机理及育性恢复关系,本研究对 4 个萝卜雄性不育系及 1 个萝卜雄性不育保持系材料进行了线粒体及叶绿体的基因组测序、组装。测序采用 PE90 策略,获得 Clean data 有 1.2 G bp 。通过数据过滤、计算测序深度及 Kmer 频度分析,确定了组装的 mer 值及覆盖度参数。... (2016年02月25日)
农杆菌介导的高粱遗传转化研究进展
高粱( Sorghum bicolor (L.) Moench)对高温和干旱具有很强的耐受能力,是干旱、半干旱地区人们理想的谷类作物。通过现代遗传转化的手段提高高粱的产量,改善其品质显得尤为重要。农杆菌介导的遗传转化是将外源基因转入植物细胞最常用的方法。然而,从2000年首次报道农杆菌介导的高粱遗传转化以来,至今成功的例子仍然非常有限。优化影响农杆菌... (2016年02月10日)
4种杜鹃幼苗高温胁迫下蛋白表达差异
为进一步明确杜鹃幼苗的耐热机制,为耐热杜鹃育种提供分子依据,本研究比较了映山红、满山红、马银花和云锦杜鹃4种耐热性不同的杜鹃幼苗在高温胁迫下蛋白质组分变化的差异。研究发现,高温胁迫导致4种杜鹃叶片蛋白质表达出现了明显差异,主要表现为蛋白质表达的下调或消失、蛋白质表达的上调或特异蛋白的出现及波动表达。其中耐热性最强的映山红有60个蛋白位点出现差异表达,其... (2016年03月25日)
猴头菇的药理作用及栽培与应用
猴头菇具有较高的食用和药用价值,子实体口味鲜美,其多糖具有抗肿瘤、降血脂、抗衰老,提高免疫力等生理功能。本文论述了猴头菇的药理功能和营养价值、多糖的提取与纯化、人工栽培技术及其市场应用开发等,并对不足之处进行了探讨和展望。目前猴头菇价格高居不下且药用功效普及度不高,应大力开发并倡导消费。 (2016年02月17日)
特有植物短丝木犀(
Osmanthus serrulatus
)转录组微卫星特征分析
利用MISA软件对短丝木犀花和叶芽转录组测序得到的92 798条独立基因(unigenes)进行SSR位点查找和分析,共搜索到11 881个SSR位点,除单碱基重复外,SSR出现频率为4.64%,分布密度为1/15.02 kb。二碱基和三碱基重复为短丝木犀SSR主要重复单元类型,分布占SSR总数的66.35%和30.42%。其中AG/CT和AAG/CT... (2016年03月25日)
珍珠半夏(
Pinellia ternate
)高效再生体系的建立及其遗传稳定性检测
本实验采用一年生珍珠半夏球茎为外植体,接种在MS+KT (1.0 μM)+NAA (0.4 μM)+蔗糖(3.0%)+琼脂(0.7%)培养基中,可在20~25天内完成芽的萌发。再生芽在MS+NAA (0.4 μM)+蔗糖(3.0%)+琼脂(0.7%)培养基中完成芽的伸长。伸长芽在MS+KT (1.0 μM)+NAA (0.4 &... (2016年03月25日)
植物WRI1基因生物信息学分析
植物转录因子 WRI1 特异性正向调控糖酵解和脂肪酸合成过程,是油料作物遗传育种工作的重要靶基因。本研究通过系统发育分析、基因结构分析和多序列比对,获得如下结论:(1) WRI1 基因属于ANT亚族,单独聚为一支,在文中称之为WRI1(ANT-ІІ)亚族。WRI1(ANT-ІІ)亚族基因按照植物的种属亲缘关系进行聚类;(2)WRI1(ANT-ІІ)亚族... (2016年01月06日)
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